Herkko ja kadonneen ajan arvoitus on alakouluikäisille suunnattu mielikuvitusrikas salapoliisitarina. Yhden toiminnantäyteisen päivän aikana punnitaan niin etsivien kuin muidenkin Kekkerikujan asukkaiden ennakkoluulot ja omat rajat, huumoria unohtamatta.

Herkko on yksinäinen yhdeksänvuotias poika, joka rakastaa salapoliisikertomuksia ja ihailee yli kaiken Hercule Poirot’ta. Herkon isä seilaa merillä, ja äidillä on kiire; hän on luvannut paistaa leikkikentän myyjäisiin neljäsataa pullaa. Ongelmana on vain aika – mihin ihmeeseen se aina katoaa?

Tästä Herkko nappaa itselleen salapoliisitehtävän. Hän alkaa etsiä kadonnutta aikaa. Avukseen Herkko saa henkiin heränneen puuhakkaan lakanan sekä naapuriin muuttaneen Martan, joka ihailee suunnattomasti neiti Marplea. Herkolla tosin on omat ennakkoluulonsa tytön sopivuudesta salapoliisiksi.

Kadonneen ajan arvoitus kuljettaa kolmikon halki Kekkerikujan, jonka värikkäisiin asukkaisiin etsivät törmäävät hakiessaan vihjeitä aikavarkaasta. Kiusaajiltakaan kolmikko ei välty. Niitä löytyy sekä lasten että aikuisten joukosta.