CLUE-ryhmä kiinnostuu lähisaarella olevasta salakuljettajan talosta. Nuoret eivät kuitenkaan pääse sisälle autioon rakennukseen, sillä kaikki ovet ja ikkunat on joko naulattu kiinni tai suljettu raskailla ketjuilla ja riippulukoilla.

Tuloksettoman tutkimusretken jälkeen he huomaavat talolta kuvaamillaan videoilla jotakin outoa ja päättävät palata selvittämään, mistä on kyse.

Cecilia, Leo, Une ja Egon-koira ovat CLUE-ryhmä. Vaaroja uhmaten he jahtaavat vihjeitä selvittääkseen rikokset. Salakuljettajan talo on sarjan kolmastoista ja viimeinen osa.